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Western blotting、EdU 与 Co-IP 在验证 PEAR1 经 Notch 信号调控成肌细胞增殖中的应用

孤屿2026-09-14 15:58:40564 阅读

以 C2C12 成肌细胞和小鼠骨骼肌损伤再生模型为对象,用 Western blotting、EdU、流式细胞术与 Co-IP 串联验证 PEAR1 通过 Notch 信号通路调控成肌细胞增殖,并定位 PEAR1 与 Notch1/Notch2 的互作证据。

骨骼肌的发育与损伤后再生依赖肌卫星细胞(MuSCs)的激活、增殖与分化,这一过程受肌源性调控因子和 Notch 等信号通路共同控制。PEAR1(platelet endothelial aggregation receptor 1)此前被报道参与 C2C12 细胞分化、牛 MuSCs 迁移与分化以及血小板生成,但其对成肌细胞增殖的作用及是否通过 Notch 信号通路发挥作用尚不明确。该研究以 C2C12 成肌细胞为体外模型、以盐酸布比卡因诱导的小鼠胫骨前肌损伤再生为体内模型,用 Western blotting 追踪 PEAR1、增殖标志物与 Notch 通路分子的表达变化,用 EdU 掺入和流式细胞术判定增殖与细胞周期状态,用 Co-IP 判定 PEAR1 与 Notch1、Notch2 的相互作用,再用 Notch 通路抑制剂 RIN1 做通路依赖性验证。

核心逻辑并非单一仪器得出单一结论,而是由三类证据分层递进:Western blotting 提供蛋白表达水平与通路分子变化的量化依据;EdU 和流式细胞术提供细胞增殖表型的直接读出;Co-IP 提供 PEAR1 与 Notch1/Notch2 发生物理互作的证据;RIN1 干预则把相关关系推向通路依赖性判断。体内部分用 HE 染色确认损伤再生模型成立,用免疫组化定位 PEAR1、Pax7、Notch1 和 Notch2 的表达位置与时相。

实验流程

实验环节仪器技术解决问题产生数据
C2C12 细胞培养与增殖时相取样细胞培养与定时取样(12 h、24 h、48 h)建立可比较的增殖时间序列不同时间点细胞蛋白样品
PEAR1 与通路分子表达检测Western blotting,MiniChemi™ 500 化学发光成像与分析系统PEAR1、Pax7、CCNB1、PCNA 及 Notch1、Notch2、Hes1、N1-ICD、N2-ICD 是否随增殖进程变化蛋白条带灰度值及倍数变化统计
PEAR1 过表达与抑制pcDNA3.1-PEAR1 转染、PEAR1-shRNA 干扰、Lipofectamine 2000建立 PEAR1 功能获得与功能缺失细胞模型过表达与抑制后的细胞样品
增殖表型判定EdU 掺入实验、荧光显微镜、Hoechst 33342 核染色PEAR1 表达改变是否直接改变 DNA 合成细胞比例EdU 阳性细胞图像及比例统计
细胞周期状态判定PI 染色、Cytomics FC500 流式细胞仪、CXP 软件PEAR1 表达改变是否影响细胞周期进程细胞周期分布数据
PEAR1 与 Notch 受体互作判定Co-IP,PEAR1/Notch1/Notch2 抗体与磁珠,磁力架PEAR1 是否与 Notch1 或 Notch2 发生物理结合IP 组、IgG 对照组、InPut 组的 Western blotting 条带
Notch 通路依赖性验证RIN1(0.6 μM)处理、Western blotting、EdU抑制 Notch 通路后 PEAR1 促增殖效应是否被阻断Hes1、Pax7、CCNB1、PCNA 表达及 EdU 阳性细胞变化
小鼠骨骼肌损伤再生模型盐酸布比卡因注射、HE 染色、光学显微镜拍照体内损伤再生模型是否成功建立0、1、3、5、7、14 天组织切片形态
体内表达与定位免疫组化、DAB 显色、BX53 正置显微镜PEAR1、Pax7、Notch1、Notch2 在损伤再生中的表达时相与定位组织切片阳性信号图像及统计

关键环节

Western blotting 建立表达变化与通路激活的证据链

该环节的目的是确认 PEAR1 与 Notch 信号通路分子在 C2C12 细胞增殖过程中是否同步变化。Western blotting 在此承担蛋白表达水平的检测与量化作用:蛋白经 SDS-PAGE 分离后转至 PVDF 膜,封闭后与 PEAR1、Notch1、Notch2、Pax7、CCNB1、PCNA、Hes1、GAPDH 等一抗孵育,再用 HRP 标记二抗和化学发光显色,由 MiniChemi™ 500 化学发光成像与分析系统成像。结果显示,从 0 h 到 48 h,PEAR1、Pax7、CCNB1、PCNA 以及 N1-ICD、N2-ICD、Hes1 均逐渐升高,其中 48 h 相对 0 h 分别升高 2 倍以上、1 倍、4 倍、3 倍、3 倍、6 倍和 4 倍不等。该数据支持 PEAR1 与 Notch 通路激活状态和 C2C12 增殖进程相关,为后续功能实验提供时间窗和分子靶点。

PEAR1 过表达与 shRNA 干扰确定功能方向

该环节的目的是判断 PEAR1 表达水平改变是否足以改变增殖状态,并观察 Notch 通路分子是否随之变化。通过 pcDNA3.1-PEAR1 转染实现过表达、以靶向 PEAR1 的 shRNA 实现抑制,48 h 后收集样品。Western blotting 显示,过表达 PEAR1 后 Pax7、CCNB1、PCNA 以及核内 N1-ICD、N2-ICD 均显著上调;抑制 PEAR1 后上述指标均下调。该数据把 PEAR1 与增殖标志物、Notch 通路激活片段建立起方向一致的变化关系,说明 PEAR1 对成肌细胞增殖具有正向调控作用,且可能与 Notch 通路相关。

EdU 与流式细胞术独立验证增殖表型

该环节的目的是用不依赖蛋白表达的读出方式验证增殖变化,降低单一 Western blotting 结论的偏差风险。EdU 实验在结束处理前 2 h 加入 EdU,经 4% 多聚甲醛固定、0.3% Triton X-100 透化、点击化学反应和 Hoechst 33342 核染后,在荧光显微镜下观察,以红色信号代表 EdU 阳性细胞、蓝色代表细胞核。结果显示过表达 PEAR1 时 EdU 阳性细胞增多,抑制 PEAR1 时减少。流式细胞术使用 Cell Cycle Analysis Kit 进行 PI 染色,经 Cytomics FC500 流式细胞仪采集并用 CXP 软件分析,结果同样显示过表达促进、抑制阻碍细胞增殖进程。两类数据与 Western blotting 结论相互印证,使「PEAR1 正向调控 C2C12 增殖」的判断不依赖单一检测层面。

Co-IP 判定 PEAR1 与 Notch1、Notch2 的物理互作

该环节的目的是回答 PEAR1 与 Notch 通路的关系是间接相关还是直接互作。Co-IP 中,PEAR1 抗体或 Notch1、Notch2 抗体先与磁珠 4 °C 孵育 2 h,再与细胞总蛋白 4 °C 孵育 2 h,用磁力架保留磁珠并弃去液体,随后对沉淀复合物进行 Western blotting 检测。以兔 IgG 作为阴性对照、InPut 作为阳性对照。结果显示,用 PEAR1 抗体沉淀时可分别检测到 Notch1 或 Notch2,而用 Notch1 或 Notch2 抗体沉淀时均可检测到 PEAR1。该双向验证数据支持 PEAR1 与 Notch1、Notch2 分别发生相互作用,为「PEAR1 可能作为 Notch 通路新配体」提供直接结合层面的证据。

RIN1 干预验证 Notch 通路依赖性

该环节的目的是判断 PEAR1 促增殖效应是否依赖 Notch 通路,而不是并行发生的独立事件。使用 RIN1(0.6 μM)阻断 RBPJ 功能以抑制 Notch 通路。Western blotting 显示,RIN1 处理后 Hes1 显著下调,说明通路抑制成立;同时 Pax7、CCNB1、PCNA 显著下调,EdU 阳性细胞减少。进一步在过表达 PEAR1 的同时加入 RIN1,结果显示即使 PEAR1 过表达,Pax7、CCNB1、PCNA 和 Hes1 也无法上调。该干预实验把此前「PEAR1 与 Notch 通路相关」的判断推进为「PEAR1 调控 C2C12 增殖主要经 Notch 信号通路实现」。

体内损伤再生模型确认 PEAR1 与 Notch 受体的时相与定位

该环节的目的是在体内环境中观察 PEAR1 是否参与骨骼肌损伤后再生,以及 Notch1 和 Notch2 是否呈现不同模式。向小鼠胫骨前肌注射 50 μL 0.5% 盐酸布比卡因溶液,于第 0、1、3、5、7、14 天取材。HE 染色显示注射后第 1 天肌纤维损伤,第 3 天出现新生小肌纤维,第 5 天出现大量新生粗肌纤维,第 14 天完成再生,确认模型成立。Western blotting 显示 PEAR1、Notch1、Notch2、Pax7、MyoD、Hes1 的表达随再生进程变化,其中 Pax7 在第 1~3 天高表达、第 5~7 天下降、第 14 天回升,MyoD 呈类似波动。免疫组化采用连续切片,以 DAB 显色、苏木素复染核,BX53 正置显微镜拍照,结果显示第 3 天 PEAR1、Notch2 和 Pax7 呈阳性,Notch1 在全过程表达并位于肌纤维边缘,部分与 Pax7 共定位;放大图像显示 Notch2 主要位于肌纤维,Notch1 主要位于 Pax7 阳性区域。该数据支持 PEAR1 参与损伤早期(第 1~3 天)的 MuSCs 增殖调控,并提示 Notch1 与 Notch2 在再生中可能承担不同角色。

技术协同

关系类型涉及仪器/技术关系说明
时序互补Western blotting 与 EdUWestern blotting 给出通路和标志物表达变化,EdU 给出 DNA 合成细胞比例,两者在同一时间窗(48 h)互相验证增殖表型
方法互证EdU 与流式细胞术EdU 以图像计数阳性细胞,流式以 PI 染色分析细胞周期分布,从不同原理确认 PEAR1 对增殖进程的影响
结合证据支撑Co-IP 与 Western blottingCo-IP 富集互作复合物,Western blotting 检测复合物中的目标蛋白,双向 IP 结果共同支持 PEAR1 与 Notch1/Notch2 的互作
干预验证RIN1 处理与 Western blotting、EdURIN1 阻断 Notch 通路后复测增殖指标,判断 PEAR1 效应是否依赖该通路
体内外衔接C2C12 细胞实验与小鼠损伤再生模型、HE 染色、免疫组化体外确定分子机制方向,体内用组织形态学和蛋白定位判断 PEAR1 与 Notch 受体的时相和空间关系

研究组合

研究目标可参考仪器组合组合价值
判断某分子是否调控成肌细胞或干细胞增殖过表达/干扰载体转染 + Western blotting(增殖标志物)+ EdU + 流式细胞术从蛋白表达和细胞表型两个层面建立功能证据,减少单一方法偏差
判断目标分子是否与某受体或通路蛋白直接互作Co-IP(双向抗体沉淀)+ Western blotting通过正反方向 IP 提供物理结合证据,区分直接互作与表达相关性
判断表型是否依赖某条信号通路通路抑制剂处理 + Western blotting(通路下游分子)+ EdU以药理学阻断检验通路依赖性,并可与过表达实验叠加判断上下游关系
在体内验证分子与通路分子的时空关系组织损伤模型 + HE 染色 + 免疫组化 + 显微成像确认模型成立并定位目标分子与标志物的表达时相和空间分布

对实验人员来说,上述组合的适用前提是:目标分子有可用的抗体和过表达/干扰工具,通路有可用的药理学抑制剂,且细胞增殖表型有稳定的检测窗口。需要看样品基质和结果用途:Co-IP 结果受裂解条件、抗体亲和力和非特异结合影响,双向 IP 加 IgG 和 InPut 对照更稳妥;EdU 和流式结果需注意细胞密度、处理时间和固定透化条件,避免接触抑制干扰读数。该文献中免疫组化提示 Notch1 和 Notch2 定位不同,说明在类似研究中不宜把同一通路的不同受体简单合并判断,更稳妥的理解是分别检测并比较其表达模式。

文献信息

Zhao Y, Zhang L, Hao R, Li S, Li S, Shi S, Tong H, Liu B. PEAR1 Promotes Myoblast Proliferation Through Notch Signaling Pathway. Biology (Basel). 2024-12-19. PMID: 39765730. DOI: 10.3390/biology13121063.