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snRNA-seq联合RNAscope鉴定过敏原诱导气道高反应中的脑干Dbh+ nTS神经元

Arin2026-09-03 17:01:57999 阅读

研究通过snRNA-seq和RNAscope鉴定nTS中Dbh+神经元亚群,结合FOS染色、化学遗传操控和病毒示踪,证实其在过敏原诱导气道高反应中的必要性和充分性,并揭示去甲肾上腺素作为nTS-NA间神经递质。

该研究旨在解析过敏原诱导气道高反应(哮喘核心特征)的完整神经回路,重点关注脑干孤束核(nTS)中接收肺迷走传入的下游神经元身份及其功能。作者通过单核RNA测序(snRNA-seq)和RNAscope技术,在nTS中鉴定出一个Dbh+神经元亚群,该亚群在反复过敏原刺激后被优先激活;结合FOS表达检测、化学/遗传操控和病毒示踪,证明该神经元群对过敏原诱导的气道高反应既是必要的也是充分条件,并进一步揭示去甲肾上腺素是Dbh+ nTS神经元至疑核(NA)的关键神经递质。研究为理解哮喘的神经免疫机制提供了分子、解剖和功能层面的证据。

实验流程

实验环节仪器技术解决问题产生数据
过敏原暴露与模型构建HDM滴鼻、FlexiVent肺功能仪建立慢性过敏原诱导气道高反应小鼠模型并评估表型肺阻力(Rrs)和弹性(Ers)数据
神经元激活检测FOS免疫组化、CLARITY组织透明化、TRAP2遗传标记定位并标记过敏原反复刺激后被激活的nTS神经元FOS+细胞分布与数量、tdTomato+细胞图像
nTS转录组图谱构建snRNA-seq(10x Genomics、NovaSeq)解析nTS神经元异质性,确定候选亚群分子标记42,157个核转录组、18个神经元簇UMAP
分子标记空间验证RNAscope(多色原位杂交)在组织水平验证snRNA-seq标记基因的空间表达和与FOS共定位标记基因与Fos共表达定量数据
功能必要性验证anti-DBH-SAP化学消融、Dbh-cre;DTR遗传消融、DREADD化学遗传抑制确定Dbh+ nTS神经元在过敏原诱导高反应中的必要性不同处理后Rrs/Ers变化、免疫染色数据
功能充分性验证DREADD化学遗传激活(hM3Dq)确定激活Dbh+ nTS神经元是否足以诱导高反应CNO处理后的Rrs/Ers数据
下游回路解析AAV顺行/逆行示踪、CTB488逆行标记绘制Dbh+ nTS神经元至NA及气道神经节的下行通路纤维投射图像、神经元标记数据
神经递质验证NA snRNA-seq、RNAscope、脑内给药(prazosin/terazosin)确定Dbh+ nTS至NA间神经递质及受体Adra1a/Adra1b表达数据、药理学干预后Rrs/Ers

关键环节

过敏原暴露与高反应表型评估

研究采用屋尘螨(HDM)反复滴鼻建立哮喘模型。为定量评估气道高反应,使用FlexiVent小动物肺功能仪在递增浓度乙酰甲胆碱(MCh)激发下测量呼吸系统阻力(Rrs)和弹性(Ers)。结果显示,HDM处理组较盐水对照组在高浓度MCh(12和24 mg ml⁻¹)下Rrs和Ers显著增加,证实模型成功诱导出气道高反应。

激活神经元定位与标记

为确定过敏原反复刺激是否激活脑干神经元,研究者首先通过FOS免疫组化染色检测即时早期基因表达。结果显示,仅在第4次HDM激发后2小时,nTS区域(bregma −7.20 至 −8.08 mm)的FOS+细胞数量显著增加,而前3次激发无显著变化,提示需要反复刺激才能建立神经条件化。为累积标记这些激活的神经元,研究者利用TRAP2(Fos2A-iCreER)与Ai14(tdTomato)小鼠系,在每次激发后注射4-OHT,并通过CLARITY透明化处理整个脑干,结合共聚焦成像观察到HDM处理组nTS中tdTomato+神经元显著增多,与FOS染色的重叠率约70%。这一结果确证了nTS神经元的重复激活,为后续消融实验提供了靶标。

nTS单核转录组图谱构建

为鉴定哪类nTS神经元对过敏原响应,研究者对来自naive、盐水对照和HDM激发小鼠的nTS组织进行snRNA-seq。利用10x Genomics Chromium平台和NovaSeq测序,经CellRanger比对、Seurat聚类和Harmony整合,共获得42,157个高质量核,其中32,880个nTS神经元划分为18个转录组簇,包含7个兴奋性和11个抑制性群体。通过RNAscope在组织水平验证了各簇的标记基因(如Gli3、Dbh),并绘制了不同簇在nTS中的空间分布图,为后续与Fos共定位实验提供了全面的分子基础。

神经元激活亚群的确定:RNAscope共定位

为直接确定过敏原激活的神经元类型,研究者采用RNAscope多重荧光原位杂交技术,在HDM激发后1.5小时检测nTS中Fos mRNA与18个簇的标记基因(如Dbh、Th、Tacr1等)的双标记。结果发现Dbh+神经元(簇13)与Fos共定位的百分比较其他簇均高(约2,342个Dbh+神经元,统计显著),且Dbh+区域与过敏原诱导的FOS+富集区域(bregma −7.20~−8.08 mm)高度重合。此外,通过Trpv1-cre小鼠的AAV示踪发现Dbh+神经元与Trpv1+迷走传入末梢在空间上邻近。这一证据链表明Dbh+ nTS神经元是被过敏原优先激活的候选群体。

功能必要性验证

研究者采用三种互补策略验证Dbh+ nTS神经元在过敏原诱导高反应中的必要性。第一种通过anti-DBH抗体偶联saporin(DBH-SAP)注入nTS实现化学消融,结果显示HDM处理后的高反应被显著减弱,而盐水对照不受影响。第二种利用Dbh-cre;DTR小鼠注射白喉毒素(DTX)进行遗传消融,同样消除了高反应。第三种采用DREADD技术(AAV-flex-hM4D(Gi))在Dbh-cre小鼠中表达抑制性受体,并在第2~4次HDM激发前给予CNO抑制神经元活动,也显著削弱高反应。同时,研究者排除了非特异性效应,确认这些操作不影响气道杯状细胞化生、2型免疫细胞浸润及细胞因子表达,表明Dbh+ nTS神经元特异性地控制神经介导的气道高反应。

功能充分性验证

为检验激活Dbh+ nTS神经元是否足以诱导高反应,研究者使用DREADD激活策略(AAV-DIO-hM3D(Gq))并在第4次HDM激发时以CNO代替HDM,观察到部分气道高反应(Rrs和Ers显著升高,程度弱于HDM),而对照病毒或naive小鼠无此效应。这表明Dbh+ nTS神经元在过敏原致敏背景下激活可诱导高反应,支持其在该回路中的关键作用。

下游通路与神经递质解析

通过AAV-flex-tdTomato在Dbh-cre小鼠nTS内注射并进行全脑追踪,发现Dbh+ nTS神经元投射至疑核(NA)。进一步在Chat-cre小鼠NA注射AAV示踪,证实NA胆碱能神经元轴突投射至气管和肺外支气管的副交感神经节,而非直接支配平滑肌。逆行追踪(CTB488注射至气管)标记到NA神经元,且NA中的Chat+神经元同时表达Adra1a和Adra1b受体。通过DREADD抑制NA神经元或抑制NA投射的Dbh+ nTS神经元,均消除高反应。最后,向NA局部给予α1-肾上腺素受体拮抗剂(prazosin或terazosin)显著减弱HDM诱导的高反应,并在化学遗传激活Dbh+ nTS神经元时同样阻断高反应,证明去甲肾上腺素是Dbh+ nTS至NA的神经递质。

技术协同

关系类型涉及仪器/技术关系说明
互补验证snRNA-seq 与 RNAscopesnRNA-seq提供高通量转录组聚类,RNAscope在组织水平验证标记基因定位和与Fos共定位,两者相互印证确认Dbh+亚群身份
功能干预与行为检测DREADD/消融 与 FlexiVent化学遗传或消融操控神经元后,利用FlexiVent量化气道功能变化,建立因果证据链
解剖追踪与分子标记AAV示踪、CTB488 与 RNAscope病毒示踪明确神经投射路径,RNAscope确定下游神经元受体表达,结合药理学验证神经递质功能

研究组合

研究目标可参考仪器组合组合价值
鉴定特定脑区激活神经元亚型并验证空间定位snRNA-seq(10x Genomics + NovaSeq)→ RNAscope多重标记 → 共聚焦显微成像从转录组层面发现候选群体,并在组织层面原位验证与激活标记共定位,特别适合复杂脑区的异质性分析
建立神经元调控与生理表型的因果关系转基因Cre系 + AAV-DREADD/化学消融探针 + FlexiVent肺功能仪通过定向操控神经元活动并测量器官功能输出,可直接检验必要性与充分性,前提是Cre特异性已验证
解析多级神经回路和神经递质AAV顺行/逆行示踪 + 逆行CTB标记 + 脑区导向给药 + RNAscope受体检测组合解剖追踪和分子药理干预,可阐明神经信号传递分子机制,适用于全身或局部生理反应相关回路

以上组合的适用前提包括:目标脑区或神经元亚群需有明确的遗传标记(如Cre系或TRAP系),生理学检测指标需稳定可重复,药物或病毒注射需通过立体定位确保靶向准确性。在类似研究中,若缺少相应Cre系,可考虑用病毒载体介导的RNA干扰或CRISPR替代;若行为学或器官功能测量不可行,也可用钙成像、电生理等细胞学指标反映神经元活性。

文献信息

Su Y, Xu J, Zhu Z, et al. Brainstem Dbh+ neurons control allergen-induced airway hyperreactivity. Nature, 2024. DOI: 10.1038/s41586-024-07608-5. PMID: 38987587.