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无标记定量蛋白质组学结合 LC-MS/MS 解析绵羊脂尾与瘦尾脂肪沉积差异蛋白

该研究以 5 个尾型不同的中国地方绵羊品种为对象,用无标记定量蛋白质组学结合 nano HPLC-QExactive MS/MS 比较尾部脂肪组织蛋白丰度,鉴定到 3400 个蛋白和 804 个差异表达蛋白,并通过 RT-qPCR、Western blot 及免疫组化验证关键蛋白与 PPAR 通路。

无标记定量蛋白质组学nano HPLC-QExactive MS/MSPEAKS差异表达蛋白
Arin733 阅读
CRISPR-Cas9 筛选与荧光自噬报告系统联用鉴定调控自噬流的新型泛素连接酶 G2E3

本研究在胰腺癌细胞中,用 CRISPR-Cas9 泛素化相关基因文库筛选联合 mCherry-GFP-LC3 自噬流报告系统与流式分选,从 660 个泛素化相关基因中锁定 G2E3,并通过共聚焦成像、免疫共沉淀和蛋白免疫印迹构建自噬流调控证据链。

CRISPR-Cas9 功能缺失筛选mCherry-GFP-LC3 自噬流报告系统荧光激活细胞分选共聚焦显微镜
Zane669 阅读
CRISPR-Cas9 激酶组文库筛选与 NGS 鉴定胰腺癌化疗增敏靶点 CDK7

该研究利用 CRISPR-Cas9 激酶组文库筛选结合 NGS 测序和 MAGeCK-VISPR 分析,在 KPC 小鼠胰腺癌细胞系 TB32047 中鉴定出 CDK7 等化疗增敏靶点,并通过细胞表型实验与体内模型验证了以 CDK7 为靶点的联合治疗策略。

CRISPR-Cas9激酶组文库NGSMAGeCK-VISPR
Zane786 阅读
空间表观组-转录组共测序:在同一组织切片上联合分析染色质可及性与基因表达

本文介绍空间ATAC-RNA-seq和空间CUT&Tag-RNA-seq两种技术,它们通过确定性共条形码在同一组织切片上同时捕获染色质可及性或组蛋白修饰与转录组信息,应用于胚胎和幼年小鼠脑及成人人脑,实现了像素级别的表观遗传调控与基因表达关联分析。

空间ATAC-RNA-seq空间CUT&Tag-RNA-seq染色质可及性组蛋白修饰
Riven878 阅读