研究以水牛孤雌激活模型为对象,用TMT标记定量蛋白质组比较MII卵母细胞与二细胞期胚胎,并用RNA-seq追踪GV至囊胚8个阶段转录组,联合定位母源向合子转变发生于8细胞至16细胞期,并验证细胞连接相关蛋白。
该研究以 5 个尾型不同的中国地方绵羊品种为对象,用无标记定量蛋白质组学结合 nano HPLC-QExactive MS/MS 比较尾部脂肪组织蛋白丰度,鉴定到 3400 个蛋白和 804 个差异表达蛋白,并通过 RT-qPCR、Western blot 及免疫组化验证关键蛋白与 PPAR 通路。
解读一项主动脉瓣狭窄多族群 GWAS 与 TWAS 研究,梳理其如何用基因分型、RNA 测序、eQTL 整合、靶基因优先级排序、多基因风险评分及 siRNA 基因沉默与茜素红矿化检测,形成从风险位点到功能基因的证据链。
本研究在胰腺癌细胞中,用 CRISPR-Cas9 泛素化相关基因文库筛选联合 mCherry-GFP-LC3 自噬流报告系统与流式分选,从 660 个泛素化相关基因中锁定 G2E3,并通过共聚焦成像、免疫共沉淀和蛋白免疫印迹构建自噬流调控证据链。
该研究利用 CRISPR-Cas9 激酶组文库筛选结合 NGS 测序和 MAGeCK-VISPR 分析,在 KPC 小鼠胰腺癌细胞系 TB32047 中鉴定出 CDK7 等化疗增敏靶点,并通过细胞表型实验与体内模型验证了以 CDK7 为靶点的联合治疗策略。
利用液相色谱质谱联用定量油菜种子代谢物,识别含油量标记代谢物,结合mGWAS、mTWAS、eQTL和WGCNA构建多组学网络,筛选并验证候选基因,阐明仪器与技术如何形成完整证据链。
利用 Oxford Nanopore 长读长测序 1019 例人类样本,结合 SAGA 线性与图参考比对、图增强和 Giggles 基因分型框架,实现超十万个结构变异与三十万个 VNTR 的群体规模解析。
本文介绍空间ATAC-RNA-seq和空间CUT&Tag-RNA-seq两种技术,它们通过确定性共条形码在同一组织切片上同时捕获染色质可及性或组蛋白修饰与转录组信息,应用于胚胎和幼年小鼠脑及成人人脑,实现了像素级别的表观遗传调控与基因表达关联分析。